Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stub1Q9WUD1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms