Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdcd6ipQ9WU78 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdcd6ipQ9WU78 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdcd6ipQ9WU78 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdcd6ipQ9WU78 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdcd6ipQ9WU78 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdcd6ipQ9WU78 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdcd6ipQ9WU78 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pdcd6ipQ9WU78 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pdcd6ipQ9WU78 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pdcd6ipQ9WU78 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pdcd6ipQ9WU78 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pdcd6ipQ9WU78 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pdcd6ipQ9WU78 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pdcd6ipQ9WU78 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pdcd6ipQ9WU78 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdcd6ipQ9WU78 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdcd6ipQ9WU78 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdcd6ipQ9WU78 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdcd6ipQ9WU78 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdcd6ipQ9WU78 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdcd6ipQ9WU78 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdcd6ipQ9WU78 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdcd6ipQ9WU78 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdcd6ipQ9WU78 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdcd6ipQ9WU78 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdcd6ipQ9WU78 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdcd6ipQ9WU78 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdcd6ipQ9WU78 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdcd6ipQ9WU78 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdcd6ipQ9WU78 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdcd6ipQ9WU78 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdcd6ipQ9WU78 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdcd6ipQ9WU78 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdcd6ipQ9WU78 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdcd6ipQ9WU78 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdcd6ipQ9WU78 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdcd6ipQ9WU78 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdcd6ipQ9WU78 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdcd6ipQ9WU78 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdcd6ipQ9WU78 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdcd6ipQ9WU78 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdcd6ipQ9WU78 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdcd6ipQ9WU78 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdcd6ipQ9WU78 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdcd6ipQ9WU78 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms