Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpc1Q9QZF2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpc1Q9QZF2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpc1Q9QZF2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpc1Q9QZF2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpc1Q9QZF2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpc1Q9QZF2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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