Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ25

Vnn3, Vascular non-inflammatory molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vnn3Q9QZ25 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vnn3Q9QZ25 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vnn3Q9QZ25 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vnn3Q9QZ25 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Vnn3Q9QZ25 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vnn3Q9QZ25 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Vnn3Q9QZ25 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vnn3Q9QZ25 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vnn3Q9QZ25 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vnn3Q9QZ25 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vnn3Q9QZ25 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vnn3Q9QZ25 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Vnn3Q9QZ25 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vnn3Q9QZ25 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vnn3Q9QZ25 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vnn3Q9QZ25 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Vnn3Q9QZ25 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vnn3Q9QZ25 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vnn3Q9QZ25 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vnn3Q9QZ25 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.2 ms