Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYY8

Spast, Spastin, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpastQ9QYY8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SpastQ9QYY8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SpastQ9QYY8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SpastQ9QYY8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SpastQ9QYY8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SpastQ9QYY8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SpastQ9QYY8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SpastQ9QYY8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SpastQ9QYY8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SpastQ9QYY8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SpastQ9QYY8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SpastQ9QYY8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SpastQ9QYY8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SpastQ9QYY8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SpastQ9QYY8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SpastQ9QYY8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SpastQ9QYY8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SpastQ9QYY8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SpastQ9QYY8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms