Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PnckQ9QYK9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PnckQ9QYK9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PnckQ9QYK9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PnckQ9QYK9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PnckQ9QYK9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PnckQ9QYK9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PnckQ9QYK9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PnckQ9QYK9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PnckQ9QYK9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PnckQ9QYK9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PnckQ9QYK9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PnckQ9QYK9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PnckQ9QYK9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PnckQ9QYK9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PnckQ9QYK9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PnckQ9QYK9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PnckQ9QYK9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PnckQ9QYK9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PnckQ9QYK9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PnckQ9QYK9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PnckQ9QYK9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PnckQ9QYK9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PnckQ9QYK9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PnckQ9QYK9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PnckQ9QYK9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PnckQ9QYK9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PnckQ9QYK9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PnckQ9QYK9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PnckQ9QYK9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PnckQ9QYK9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PnckQ9QYK9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PnckQ9QYK9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PnckQ9QYK9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms