Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Irx4Q9QY61 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irx4Q9QY61 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.3 ms