Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyth1Q9QX11 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyth1Q9QX11 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyth1Q9QX11 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyth1Q9QX11 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyth1Q9QX11 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyth1Q9QX11 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyth1Q9QX11 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyth1Q9QX11 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyth1Q9QX11 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyth1Q9QX11 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyth1Q9QX11 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyth1Q9QX11 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyth1Q9QX11 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyth1Q9QX11 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyth1Q9QX11 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyth1Q9QX11 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyth1Q9QX11 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyth1Q9QX11 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyth1Q9QX11 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyth1Q9QX11 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyth1Q9QX11 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyth1Q9QX11 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyth1Q9QX11 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyth1Q9QX11 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyth1Q9QX11 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyth1Q9QX11 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyth1Q9QX11 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyth1Q9QX11 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyth1Q9QX11 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyth1Q9QX11 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyth1Q9QX11 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cyth1Q9QX11 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms