Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc2lQ9JME7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc2lQ9JME7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms