Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms