Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gkap1Q9JMB0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gkap1Q9JMB0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gkap1Q9JMB0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gkap1Q9JMB0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gkap1Q9JMB0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gkap1Q9JMB0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gkap1Q9JMB0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gkap1Q9JMB0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gkap1Q9JMB0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gkap1Q9JMB0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gkap1Q9JMB0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gkap1Q9JMB0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gkap1Q9JMB0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gkap1Q9JMB0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gkap1Q9JMB0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gkap1Q9JMB0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gkap1Q9JMB0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gkap1Q9JMB0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gkap1Q9JMB0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gkap1Q9JMB0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gkap1Q9JMB0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gkap1Q9JMB0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gkap1Q9JMB0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gkap1Q9JMB0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gkap1Q9JMB0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gkap1Q9JMB0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gkap1Q9JMB0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gkap1Q9JMB0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gkap1Q9JMB0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gkap1Q9JMB0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gkap1Q9JMB0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gkap1Q9JMB0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gkap1Q9JMB0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gkap1Q9JMB0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gkap1Q9JMB0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms