Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Higd1aQ9JLR9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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