Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmx1aQ9JKU8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmx1aQ9JKU8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmx1aQ9JKU8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmx1aQ9JKU8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmx1aQ9JKU8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmx1aQ9JKU8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmx1aQ9JKU8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmx1aQ9JKU8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmx1aQ9JKU8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmx1aQ9JKU8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmx1aQ9JKU8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmx1aQ9JKU8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmx1aQ9JKU8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmx1aQ9JKU8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmx1aQ9JKU8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmx1aQ9JKU8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmx1aQ9JKU8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmx1aQ9JKU8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmx1aQ9JKU8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmx1aQ9JKU8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lmx1aQ9JKU8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmx1aQ9JKU8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms