Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV5

Cacng3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng3Q9JJV5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacng3Q9JJV5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacng3Q9JJV5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacng3Q9JJV5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacng3Q9JJV5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacng3Q9JJV5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacng3Q9JJV5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacng3Q9JJV5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacng3Q9JJV5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacng3Q9JJV5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacng3Q9JJV5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacng3Q9JJV5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacng3Q9JJV5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacng3Q9JJV5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacng3Q9JJV5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacng3Q9JJV5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacng3Q9JJV5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacng3Q9JJV5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacng3Q9JJV5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacng3Q9JJV5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacng3Q9JJV5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cacng3Q9JJV5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacng3Q9JJV5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms