Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl28Q9JIL2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms