Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LratQ9JI60 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LratQ9JI60 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LratQ9JI60 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LratQ9JI60 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LratQ9JI60 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LratQ9JI60 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LratQ9JI60 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LratQ9JI60 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LratQ9JI60 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LratQ9JI60 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LratQ9JI60 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LratQ9JI60 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LratQ9JI60 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LratQ9JI60 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LratQ9JI60 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LratQ9JI60 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LratQ9JI60 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LratQ9JI60 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LratQ9JI60 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LratQ9JI60 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LratQ9JI60 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LratQ9JI60 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LratQ9JI60 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LratQ9JI60 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LratQ9JI60 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LratQ9JI60 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LratQ9JI60 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LratQ9JI60 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LratQ9JI60 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms