Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmod3Q9JHJ0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmod3Q9JHJ0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmod3Q9JHJ0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmod3Q9JHJ0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmod3Q9JHJ0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmod3Q9JHJ0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmod3Q9JHJ0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmod3Q9JHJ0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmod3Q9JHJ0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmod3Q9JHJ0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmod3Q9JHJ0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmod3Q9JHJ0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmod3Q9JHJ0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmod3Q9JHJ0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmod3Q9JHJ0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmod3Q9JHJ0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmod3Q9JHJ0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmod3Q9JHJ0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmod3Q9JHJ0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmod3Q9JHJ0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmod3Q9JHJ0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmod3Q9JHJ0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmod3Q9JHJ0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmod3Q9JHJ0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmod3Q9JHJ0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmod3Q9JHJ0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmod3Q9JHJ0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmod3Q9JHJ0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmod3Q9JHJ0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmod3Q9JHJ0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmod3Q9JHJ0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmod3Q9JHJ0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmod3Q9JHJ0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmod3Q9JHJ0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmod3Q9JHJ0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmod3Q9JHJ0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmod3Q9JHJ0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmod3Q9JHJ0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms