Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zcchc17Q9ESX4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zcchc17Q9ESX4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Zcchc17Q9ESX4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Zcchc17Q9ESX4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zcchc17Q9ESX4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zcchc17Q9ESX4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zcchc17Q9ESX4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zcchc17Q9ESX4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zcchc17Q9ESX4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zcchc17Q9ESX4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zcchc17Q9ESX4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zcchc17Q9ESX4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zcchc17Q9ESX4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zcchc17Q9ESX4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zcchc17Q9ESX4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zcchc17Q9ESX4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Zcchc17Q9ESX4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zcchc17Q9ESX4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zcchc17Q9ESX4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zcchc17Q9ESX4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zcchc17Q9ESX4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zcchc17Q9ESX4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zcchc17Q9ESX4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zcchc17Q9ESX4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zcchc17Q9ESX4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zcchc17Q9ESX4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zcchc17Q9ESX4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Zcchc17Q9ESX4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zcchc17Q9ESX4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zcchc17Q9ESX4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zcchc17Q9ESX4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zcchc17Q9ESX4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zcchc17Q9ESX4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Zcchc17Q9ESX4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zcchc17Q9ESX4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zcchc17Q9ESX4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zcchc17Q9ESX4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zcchc17Q9ESX4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zcchc17Q9ESX4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Zcchc17Q9ESX4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zcchc17Q9ESX4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zcchc17Q9ESX4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zcchc17Q9ESX4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zcchc17Q9ESX4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zcchc17Q9ESX4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zcchc17Q9ESX4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zcchc17Q9ESX4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zcchc17Q9ESX4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zcchc17Q9ESX4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zcchc17Q9ESX4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zcchc17Q9ESX4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zcchc17Q9ESX4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zcchc17Q9ESX4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms