Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

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Length 1,160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
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Aff4Q9ESC8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aff4Q9ESC8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aff4Q9ESC8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aff4Q9ESC8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aff4Q9ESC8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aff4Q9ESC8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aff4Q9ESC8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aff4Q9ESC8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aff4Q9ESC8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aff4Q9ESC8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aff4Q9ESC8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aff4Q9ESC8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Aff4Q9ESC8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aff4Q9ESC8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Aff4Q9ESC8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Aff4Q9ESC8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Aff4Q9ESC8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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Aff4Q9ESC8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aff4Q9ESC8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aff4Q9ESC8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aff4Q9ESC8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aff4Q9ESC8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aff4Q9ESC8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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Aff4Q9ESC8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aff4Q9ESC8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aff4Q9ESC8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aff4Q9ESC8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aff4Q9ESC8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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Aff4Q9ESC8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aff4Q9ESC8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aff4Q9ESC8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aff4Q9ESC8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Aff4Q9ESC8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Aff4Q9ESC8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aff4Q9ESC8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aff4Q9ESC8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aff4Q9ESC8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Aff4Q9ESC8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Aff4Q9ESC8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Aff4Q9ESC8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Aff4Q9ESC8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Aff4Q9ESC8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Aff4Q9ESC8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Aff4Q9ESC8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Aff4Q9ESC8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
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Aff4Q9ESC8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aff4Q9ESC8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aff4Q9ESC8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aff4Q9ESC8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aff4Q9ESC8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aff4Q9ESC8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aff4Q9ESC8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms