Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ush1cQ9ES64 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ush1cQ9ES64 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ush1cQ9ES64 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ush1cQ9ES64 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ush1cQ9ES64 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ush1cQ9ES64 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ush1cQ9ES64 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ush1cQ9ES64 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ush1cQ9ES64 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ush1cQ9ES64 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ush1cQ9ES64 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ush1cQ9ES64 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ush1cQ9ES64 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ush1cQ9ES64 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ush1cQ9ES64 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ush1cQ9ES64 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ush1cQ9ES64 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ush1cQ9ES64 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ush1cQ9ES64 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ush1cQ9ES64 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ush1cQ9ES64 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ush1cQ9ES64 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ush1cQ9ES64 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ush1cQ9ES64 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ush1cQ9ES64 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ush1cQ9ES64 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ush1cQ9ES64 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ush1cQ9ES64 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ush1cQ9ES64 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ush1cQ9ES64 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ush1cQ9ES64 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ush1cQ9ES64 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ush1cQ9ES64 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ush1cQ9ES64 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ush1cQ9ES64 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ush1cQ9ES64 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ush1cQ9ES64 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ush1cQ9ES64 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ush1cQ9ES64 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ush1cQ9ES64 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ush1cQ9ES64 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ush1cQ9ES64 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ush1cQ9ES64 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ush1cQ9ES64 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ush1cQ9ES64 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ush1cQ9ES64 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ush1cQ9ES64 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ush1cQ9ES64 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ush1cQ9ES64 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ush1cQ9ES64 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ush1cQ9ES64 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ush1cQ9ES64 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ush1cQ9ES64 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ush1cQ9ES64 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ush1cQ9ES64 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ush1cQ9ES64 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ush1cQ9ES64 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ush1cQ9ES64 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ush1cQ9ES64 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ush1cQ9ES64 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms