Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Stx12Q9ER00 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Stx12Q9ER00 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Stx12Q9ER00 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Stx12Q9ER00 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Stx12Q9ER00 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Stx12Q9ER00 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Stx12Q9ER00 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Stx12Q9ER00 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Stx12Q9ER00 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Stx12Q9ER00 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Stx12Q9ER00 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Stx12Q9ER00 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Stx12Q9ER00 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Stx12Q9ER00 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Stx12Q9ER00 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Stx12Q9ER00 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Stx12Q9ER00 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms