Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ28

Pold3, DNA polymerase delta subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold3Q9EQ28 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pold3Q9EQ28 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pold3Q9EQ28 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pold3Q9EQ28 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pold3Q9EQ28 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pold3Q9EQ28 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pold3Q9EQ28 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pold3Q9EQ28 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pold3Q9EQ28 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pold3Q9EQ28 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pold3Q9EQ28 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pold3Q9EQ28 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pold3Q9EQ28 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pold3Q9EQ28 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pold3Q9EQ28 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pold3Q9EQ28 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pold3Q9EQ28 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pold3Q9EQ28 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pold3Q9EQ28 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pold3Q9EQ28 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pold3Q9EQ28 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pold3Q9EQ28 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pold3Q9EQ28 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pold3Q9EQ28 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pold3Q9EQ28 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pold3Q9EQ28 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pold3Q9EQ28 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pold3Q9EQ28 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pold3Q9EQ28 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pold3Q9EQ28 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pold3Q9EQ28 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pold3Q9EQ28 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pold3Q9EQ28 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pold3Q9EQ28 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pold3Q9EQ28 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pold3Q9EQ28 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pold3Q9EQ28 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pold3Q9EQ28 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pold3Q9EQ28 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pold3Q9EQ28 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pold3Q9EQ28 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pold3Q9EQ28 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pold3Q9EQ28 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pold3Q9EQ28 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pold3Q9EQ28 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pold3Q9EQ28 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pold3Q9EQ28 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pold3Q9EQ28 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pold3Q9EQ28 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pold3Q9EQ28 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pold3Q9EQ28 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pold3Q9EQ28 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pold3Q9EQ28 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pold3Q9EQ28 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pold3Q9EQ28 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pold3Q9EQ28 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pold3Q9EQ28 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pold3Q9EQ28 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pold3Q9EQ28 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pold3Q9EQ28 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pold3Q9EQ28 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pold3Q9EQ28 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pold3Q9EQ28 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms