Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPW9

Tlr6, Toll-like receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr6Q9EPW9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tlr6Q9EPW9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tlr6Q9EPW9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tlr6Q9EPW9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlr6Q9EPW9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlr6Q9EPW9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlr6Q9EPW9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlr6Q9EPW9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlr6Q9EPW9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlr6Q9EPW9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlr6Q9EPW9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlr6Q9EPW9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlr6Q9EPW9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlr6Q9EPW9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlr6Q9EPW9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlr6Q9EPW9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlr6Q9EPW9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlr6Q9EPW9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr6Q9EPW9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr6Q9EPW9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr6Q9EPW9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr6Q9EPW9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr6Q9EPW9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tlr6Q9EPW9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tlr6Q9EPW9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tlr6Q9EPW9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tlr6Q9EPW9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tlr6Q9EPW9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlr6Q9EPW9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlr6Q9EPW9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlr6Q9EPW9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlr6Q9EPW9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlr6Q9EPW9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlr6Q9EPW9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlr6Q9EPW9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlr6Q9EPW9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlr6Q9EPW9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlr6Q9EPW9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlr6Q9EPW9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tlr6Q9EPW9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tlr6Q9EPW9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tlr6Q9EPW9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tlr6Q9EPW9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tlr6Q9EPW9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlr6Q9EPW9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlr6Q9EPW9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlr6Q9EPW9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlr6Q9EPW9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlr6Q9EPW9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlr6Q9EPW9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlr6Q9EPW9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tlr6Q9EPW9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tlr6Q9EPW9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tlr6Q9EPW9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tlr6Q9EPW9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tlr6Q9EPW9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tlr6Q9EPW9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tlr6Q9EPW9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tlr6Q9EPW9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tlr6Q9EPW9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tlr6Q9EPW9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tlr6Q9EPW9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tlr6Q9EPW9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tlr6Q9EPW9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tlr6Q9EPW9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tlr6Q9EPW9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tlr6Q9EPW9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tlr6Q9EPW9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.3 ms