Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCE5

Pak1ip1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1ip1Q9DCE5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pak1ip1Q9DCE5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pak1ip1Q9DCE5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pak1ip1Q9DCE5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms