Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC60

Ubiad1, UbiA prenyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubiad1Q9DC60 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubiad1Q9DC60 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubiad1Q9DC60 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubiad1Q9DC60 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubiad1Q9DC60 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubiad1Q9DC60 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubiad1Q9DC60 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubiad1Q9DC60 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubiad1Q9DC60 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubiad1Q9DC60 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubiad1Q9DC60 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubiad1Q9DC60 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubiad1Q9DC60 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubiad1Q9DC60 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubiad1Q9DC60 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubiad1Q9DC60 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubiad1Q9DC60 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubiad1Q9DC60 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubiad1Q9DC60 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubiad1Q9DC60 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubiad1Q9DC60 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubiad1Q9DC60 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubiad1Q9DC60 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubiad1Q9DC60 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubiad1Q9DC60 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubiad1Q9DC60 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ubiad1Q9DC60 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ubiad1Q9DC60 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ubiad1Q9DC60 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubiad1Q9DC60 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubiad1Q9DC60 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubiad1Q9DC60 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubiad1Q9DC60 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubiad1Q9DC60 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubiad1Q9DC60 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubiad1Q9DC60 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubiad1Q9DC60 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubiad1Q9DC60 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubiad1Q9DC60 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubiad1Q9DC60 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubiad1Q9DC60 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubiad1Q9DC60 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubiad1Q9DC60 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubiad1Q9DC60 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubiad1Q9DC60 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubiad1Q9DC60 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubiad1Q9DC60 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubiad1Q9DC60 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubiad1Q9DC60 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubiad1Q9DC60 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubiad1Q9DC60 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubiad1Q9DC60 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubiad1Q9DC60 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubiad1Q9DC60 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubiad1Q9DC60 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubiad1Q9DC60 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubiad1Q9DC60 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubiad1Q9DC60 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubiad1Q9DC60 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubiad1Q9DC60 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubiad1Q9DC60 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms