Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SrpraQ9DBG7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrpraQ9DBG7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrpraQ9DBG7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrpraQ9DBG7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrpraQ9DBG7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrpraQ9DBG7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SrpraQ9DBG7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrpraQ9DBG7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrpraQ9DBG7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrpraQ9DBG7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrpraQ9DBG7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrpraQ9DBG7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrpraQ9DBG7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrpraQ9DBG7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 336.9 ms