Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf4Q9DAW6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf4Q9DAW6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf4Q9DAW6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf4Q9DAW6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf4Q9DAW6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf4Q9DAW6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf4Q9DAW6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf4Q9DAW6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf4Q9DAW6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf4Q9DAW6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf4Q9DAW6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf4Q9DAW6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf4Q9DAW6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf4Q9DAW6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf4Q9DAW6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf4Q9DAW6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf4Q9DAW6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf4Q9DAW6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf4Q9DAW6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf4Q9DAW6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf4Q9DAW6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf4Q9DAW6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf4Q9DAW6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf4Q9DAW6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf4Q9DAW6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf4Q9DAW6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf4Q9DAW6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf4Q9DAW6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf4Q9DAW6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf4Q9DAW6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf4Q9DAW6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf4Q9DAW6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf4Q9DAW6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf4Q9DAW6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf4Q9DAW6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms