Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAG9

Phf7, PHD finger protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf7Q9DAG9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf7Q9DAG9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf7Q9DAG9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf7Q9DAG9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf7Q9DAG9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf7Q9DAG9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf7Q9DAG9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf7Q9DAG9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Phf7Q9DAG9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Phf7Q9DAG9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Phf7Q9DAG9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Phf7Q9DAG9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Phf7Q9DAG9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Phf7Q9DAG9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Phf7Q9DAG9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Phf7Q9DAG9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Phf7Q9DAG9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Phf7Q9DAG9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Phf7Q9DAG9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf7Q9DAG9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf7Q9DAG9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms