Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rsph3bQ9DA80 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rsph3bQ9DA80 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rsph3bQ9DA80 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsph3bQ9DA80 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsph3bQ9DA80 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsph3bQ9DA80 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsph3bQ9DA80 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsph3bQ9DA80 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsph3bQ9DA80 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsph3bQ9DA80 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsph3bQ9DA80 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsph3bQ9DA80 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsph3bQ9DA80 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsph3bQ9DA80 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsph3bQ9DA80 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsph3bQ9DA80 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsph3bQ9DA80 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsph3bQ9DA80 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsph3bQ9DA80 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsph3bQ9DA80 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsph3bQ9DA80 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsph3bQ9DA80 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsph3bQ9DA80 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph3bQ9DA80 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph3bQ9DA80 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph3bQ9DA80 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph3bQ9DA80 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsph3bQ9DA80 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph3bQ9DA80 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph3bQ9DA80 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph3bQ9DA80 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rsph3bQ9DA80 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms