Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9P8

Llcfc1, LLLL and CFNLAS motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Llcfc1Q9D9P8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Llcfc1Q9D9P8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Llcfc1Q9D9P8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Llcfc1Q9D9P8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Llcfc1Q9D9P8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Llcfc1Q9D9P8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Llcfc1Q9D9P8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Llcfc1Q9D9P8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Llcfc1Q9D9P8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Llcfc1Q9D9P8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Llcfc1Q9D9P8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Llcfc1Q9D9P8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Llcfc1Q9D9P8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Llcfc1Q9D9P8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Llcfc1Q9D9P8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Llcfc1Q9D9P8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Llcfc1Q9D9P8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Llcfc1Q9D9P8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Llcfc1Q9D9P8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Llcfc1Q9D9P8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Llcfc1Q9D9P8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Llcfc1Q9D9P8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Llcfc1Q9D9P8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Llcfc1Q9D9P8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Llcfc1Q9D9P8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Llcfc1Q9D9P8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Llcfc1Q9D9P8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Llcfc1Q9D9P8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Llcfc1Q9D9P8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Llcfc1Q9D9P8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Llcfc1Q9D9P8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Llcfc1Q9D9P8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Llcfc1Q9D9P8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Llcfc1Q9D9P8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Llcfc1Q9D9P8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Llcfc1Q9D9P8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Llcfc1Q9D9P8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Llcfc1Q9D9P8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Llcfc1Q9D9P8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Llcfc1Q9D9P8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Llcfc1Q9D9P8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Llcfc1Q9D9P8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Llcfc1Q9D9P8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Llcfc1Q9D9P8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Llcfc1Q9D9P8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Llcfc1Q9D9P8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Llcfc1Q9D9P8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Llcfc1Q9D9P8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Llcfc1Q9D9P8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Llcfc1Q9D9P8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Llcfc1Q9D9P8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Llcfc1Q9D9P8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Llcfc1Q9D9P8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Llcfc1Q9D9P8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Llcfc1Q9D9P8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Llcfc1Q9D9P8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Llcfc1Q9D9P8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Llcfc1Q9D9P8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Llcfc1Q9D9P8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Llcfc1Q9D9P8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Llcfc1Q9D9P8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Llcfc1Q9D9P8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Llcfc1Q9D9P8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Llcfc1Q9D9P8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Llcfc1Q9D9P8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Llcfc1Q9D9P8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.6 ms