Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Mrpl17Q9D8P4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mrpl17Q9D8P4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mrpl17Q9D8P4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mrpl17Q9D8P4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mrpl17Q9D8P4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mrpl17Q9D8P4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mrpl17Q9D8P4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mrpl17Q9D8P4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mrpl17Q9D8P4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mrpl17Q9D8P4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mrpl17Q9D8P4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mrpl17Q9D8P4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl17Q9D8P4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Mrpl17Q9D8P4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms