Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D8L0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q9D8L0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D8L0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8L0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8L0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8L0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D8L0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms