Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpl4Q9D8E6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpl4Q9D8E6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpl4Q9D8E6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpl4Q9D8E6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpl4Q9D8E6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpl4Q9D8E6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpl4Q9D8E6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpl4Q9D8E6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpl4Q9D8E6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpl4Q9D8E6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpl4Q9D8E6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpl4Q9D8E6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpl4Q9D8E6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpl4Q9D8E6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpl4Q9D8E6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpl4Q9D8E6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpl4Q9D8E6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpl4Q9D8E6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpl4Q9D8E6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpl4Q9D8E6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpl4Q9D8E6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpl4Q9D8E6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpl4Q9D8E6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpl4Q9D8E6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpl4Q9D8E6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpl4Q9D8E6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpl4Q9D8E6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl4Q9D8E6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl4Q9D8E6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl4Q9D8E6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl4Q9D8E6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms