Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S0

Lypd8, Ly6/PLAUR domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lypd8Q9D7S0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lypd8Q9D7S0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lypd8Q9D7S0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lypd8Q9D7S0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lypd8Q9D7S0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lypd8Q9D7S0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lypd8Q9D7S0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lypd8Q9D7S0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lypd8Q9D7S0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lypd8Q9D7S0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lypd8Q9D7S0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lypd8Q9D7S0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lypd8Q9D7S0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lypd8Q9D7S0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lypd8Q9D7S0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lypd8Q9D7S0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lypd8Q9D7S0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lypd8Q9D7S0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms