Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MsraQ9D6Y7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MsraQ9D6Y7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MsraQ9D6Y7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MsraQ9D6Y7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MsraQ9D6Y7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MsraQ9D6Y7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MsraQ9D6Y7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MsraQ9D6Y7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MsraQ9D6Y7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MsraQ9D6Y7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MsraQ9D6Y7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MsraQ9D6Y7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MsraQ9D6Y7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms