Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J4

Necab3, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab3Q9D6J4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Necab3Q9D6J4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Necab3Q9D6J4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Necab3Q9D6J4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Necab3Q9D6J4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Necab3Q9D6J4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Necab3Q9D6J4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Necab3Q9D6J4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Necab3Q9D6J4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Necab3Q9D6J4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Necab3Q9D6J4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Necab3Q9D6J4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Necab3Q9D6J4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Necab3Q9D6J4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Necab3Q9D6J4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Necab3Q9D6J4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Necab3Q9D6J4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Necab3Q9D6J4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Necab3Q9D6J4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Necab3Q9D6J4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Necab3Q9D6J4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Necab3Q9D6J4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Necab3Q9D6J4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Necab3Q9D6J4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Necab3Q9D6J4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Necab3Q9D6J4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Necab3Q9D6J4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms