Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Speer4f1Q9D5Q6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Speer4f1Q9D5Q6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Speer4f1Q9D5Q6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Speer4f1Q9D5Q6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Speer4f1Q9D5Q6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Speer4f1Q9D5Q6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Speer4f1Q9D5Q6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Speer4f1Q9D5Q6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Speer4f1Q9D5Q6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Speer4f1Q9D5Q6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Speer4f1Q9D5Q6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Speer4f1Q9D5Q6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Speer4f1Q9D5Q6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Speer4f1Q9D5Q6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Speer4f1Q9D5Q6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Speer4f1Q9D5Q6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Speer4f1Q9D5Q6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Speer4f1Q9D5Q6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Speer4f1Q9D5Q6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Speer4f1Q9D5Q6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Speer4f1Q9D5Q6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Speer4f1Q9D5Q6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Speer4f1Q9D5Q6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Speer4f1Q9D5Q6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Speer4f1Q9D5Q6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Speer4f1Q9D5Q6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Speer4f1Q9D5Q6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Speer4f1Q9D5Q6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms