Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Zcchc13Q9D548 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zcchc13Q9D548 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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