Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Q9D4W2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Q9D4W2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Q9D4W2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Q9D4W2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Q9D4W2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Q9D4W2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Q9D4W2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Q9D4W2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Q9D4W2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Q9D4W2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Q9D4W2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Q9D4W2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Q9D4W2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Q9D4W2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Q9D4W2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Q9D4W2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Q9D4W2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Q9D4W2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Q9D4W2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Q9D4W2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Q9D4W2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Q9D4W2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Q9D4W2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Q9D4W2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Q9D4W2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Q9D4W2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q9D4W2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q9D4W2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q9D4W2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q9D4W2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q9D4W2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q9D4W2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q9D4W2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q9D4W2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q9D4W2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Q9D4W2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Q9D4W2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q9D4W2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9D4W2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q9D4W2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D4W2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms