Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pabpc6Q9D4E6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pabpc6Q9D4E6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pabpc6Q9D4E6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pabpc6Q9D4E6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pabpc6Q9D4E6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Pabpc6Q9D4E6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Pabpc6Q9D4E6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pabpc6Q9D4E6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pabpc6Q9D4E6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pabpc6Q9D4E6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pabpc6Q9D4E6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pabpc6Q9D4E6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pabpc6Q9D4E6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pabpc6Q9D4E6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pabpc6Q9D4E6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pabpc6Q9D4E6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pabpc6Q9D4E6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pabpc6Q9D4E6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pabpc6Q9D4E6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pabpc6Q9D4E6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pabpc6Q9D4E6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pabpc6Q9D4E6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pabpc6Q9D4E6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pabpc6Q9D4E6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pabpc6Q9D4E6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pabpc6Q9D4E6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pabpc6Q9D4E6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pabpc6Q9D4E6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pabpc6Q9D4E6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pabpc6Q9D4E6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pabpc6Q9D4E6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pabpc6Q9D4E6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pabpc6Q9D4E6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pabpc6Q9D4E6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pabpc6Q9D4E6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pabpc6Q9D4E6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pabpc6Q9D4E6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pabpc6Q9D4E6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pabpc6Q9D4E6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pabpc6Q9D4E6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pabpc6Q9D4E6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pabpc6Q9D4E6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pabpc6Q9D4E6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pabpc6Q9D4E6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pabpc6Q9D4E6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pabpc6Q9D4E6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pabpc6Q9D4E6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pabpc6Q9D4E6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pabpc6Q9D4E6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pabpc6Q9D4E6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pabpc6Q9D4E6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pabpc6Q9D4E6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pabpc6Q9D4E6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pabpc6Q9D4E6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pabpc6Q9D4E6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pabpc6Q9D4E6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pabpc6Q9D4E6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pabpc6Q9D4E6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pabpc6Q9D4E6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pabpc6Q9D4E6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms