Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3V8

Fam227a, Family with sequence similarity 227, member A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227aQ9D3V8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam227aQ9D3V8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms