Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx29Q9D3S3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx29Q9D3S3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx29Q9D3S3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx29Q9D3S3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx29Q9D3S3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx29Q9D3S3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx29Q9D3S3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx29Q9D3S3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx29Q9D3S3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx29Q9D3S3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx29Q9D3S3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx29Q9D3S3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx29Q9D3S3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx29Q9D3S3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx29Q9D3S3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx29Q9D3S3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx29Q9D3S3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx29Q9D3S3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx29Q9D3S3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx29Q9D3S3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx29Q9D3S3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx29Q9D3S3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx29Q9D3S3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx29Q9D3S3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Snx29Q9D3S3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Snx29Q9D3S3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx29Q9D3S3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx29Q9D3S3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx29Q9D3S3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx29Q9D3S3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx29Q9D3S3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx29Q9D3S3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx29Q9D3S3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx29Q9D3S3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx29Q9D3S3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx29Q9D3S3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx29Q9D3S3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx29Q9D3S3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx29Q9D3S3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx29Q9D3S3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx29Q9D3S3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx29Q9D3S3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx29Q9D3S3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx29Q9D3S3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx29Q9D3S3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx29Q9D3S3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx29Q9D3S3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx29Q9D3S3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx29Q9D3S3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx29Q9D3S3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx29Q9D3S3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx29Q9D3S3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx29Q9D3S3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms