Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pramef12Q9D2F1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pramef12Q9D2F1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pramef12Q9D2F1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pramef12Q9D2F1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pramef12Q9D2F1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pramef12Q9D2F1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pramef12Q9D2F1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pramef12Q9D2F1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pramef12Q9D2F1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pramef12Q9D2F1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pramef12Q9D2F1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pramef12Q9D2F1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pramef12Q9D2F1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pramef12Q9D2F1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Pramef12Q9D2F1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pramef12Q9D2F1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pramef12Q9D2F1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pramef12Q9D2F1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pramef12Q9D2F1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pramef12Q9D2F1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pramef12Q9D2F1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pramef12Q9D2F1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pramef12Q9D2F1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pramef12Q9D2F1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pramef12Q9D2F1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pramef12Q9D2F1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pramef12Q9D2F1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pramef12Q9D2F1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pramef12Q9D2F1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pramef12Q9D2F1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pramef12Q9D2F1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pramef12Q9D2F1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms