Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F5

Mrnip, MRN complex-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MrnipQ9D1F5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms