Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E6

Tbcb, Tubulin-folding cofactor B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcbQ9D1E6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TbcbQ9D1E6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TbcbQ9D1E6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TbcbQ9D1E6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TbcbQ9D1E6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TbcbQ9D1E6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TbcbQ9D1E6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TbcbQ9D1E6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TbcbQ9D1E6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TbcbQ9D1E6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TbcbQ9D1E6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TbcbQ9D1E6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TbcbQ9D1E6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TbcbQ9D1E6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TbcbQ9D1E6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TbcbQ9D1E6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TbcbQ9D1E6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TbcbQ9D1E6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TbcbQ9D1E6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TbcbQ9D1E6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TbcbQ9D1E6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TbcbQ9D1E6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TbcbQ9D1E6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TbcbQ9D1E6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TbcbQ9D1E6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TbcbQ9D1E6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TbcbQ9D1E6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TbcbQ9D1E6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TbcbQ9D1E6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TbcbQ9D1E6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TbcbQ9D1E6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TbcbQ9D1E6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TbcbQ9D1E6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TbcbQ9D1E6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TbcbQ9D1E6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TbcbQ9D1E6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TbcbQ9D1E6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TbcbQ9D1E6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TbcbQ9D1E6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TbcbQ9D1E6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TbcbQ9D1E6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TbcbQ9D1E6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TbcbQ9D1E6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TbcbQ9D1E6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TbcbQ9D1E6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TbcbQ9D1E6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TbcbQ9D1E6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TbcbQ9D1E6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TbcbQ9D1E6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TbcbQ9D1E6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TbcbQ9D1E6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TbcbQ9D1E6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TbcbQ9D1E6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TbcbQ9D1E6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TbcbQ9D1E6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TbcbQ9D1E6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TbcbQ9D1E6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TbcbQ9D1E6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TbcbQ9D1E6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TbcbQ9D1E6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TbcbQ9D1E6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms