Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms