Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Exo5Q9CXP9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Exo5Q9CXP9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Exo5Q9CXP9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Exo5Q9CXP9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Exo5Q9CXP9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Exo5Q9CXP9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Exo5Q9CXP9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Exo5Q9CXP9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Exo5Q9CXP9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Exo5Q9CXP9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Exo5Q9CXP9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Exo5Q9CXP9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Exo5Q9CXP9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Exo5Q9CXP9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Exo5Q9CXP9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Exo5Q9CXP9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Exo5Q9CXP9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Exo5Q9CXP9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Exo5Q9CXP9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Exo5Q9CXP9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Exo5Q9CXP9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms