Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
4930553M12RikQ9CUH1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms