Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sft2d3Q9CSV6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.9 ms