Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snw1Q9CSN1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snw1Q9CSN1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snw1Q9CSN1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snw1Q9CSN1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snw1Q9CSN1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snw1Q9CSN1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snw1Q9CSN1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snw1Q9CSN1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snw1Q9CSN1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snw1Q9CSN1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snw1Q9CSN1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Snw1Q9CSN1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snw1Q9CSN1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snw1Q9CSN1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Snw1Q9CSN1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snw1Q9CSN1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snw1Q9CSN1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snw1Q9CSN1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snw1Q9CSN1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snw1Q9CSN1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snw1Q9CSN1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snw1Q9CSN1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms